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剑桥大学最新论文实锤新冠病毒源自美国？这篇文章分析清楚了

百家作者：腾讯科技 2020-04-11 22:47:18

1、这篇论文从“全球共享流感数据倡议组织”中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了系统进化网络。

2、他们发现全球感染人类的病毒可分为ABC三个类群。A群新冠病毒，是在人类社会里传播的最原始的病毒，A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现，更多出现在美国和澳大利亚。B群新冠病毒，被认为是通过A群突变而来，分布以亚洲为主，但是亚洲以外的每个B群都进化出了突变；而C群冠状病毒被认为是B群突变而来，在中国大陆不存在，主要在欧洲分布。

3、为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现，这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统，所以才变异成了B型，但也可能是因为当地更多的病例是由B型感染者传染出去的，即遗传学上的“奠基者效应”（founder effect）。

4、其实，这篇论文本身其实并没有直接回复大家都关心的问题“新冠病毒是起源于美国，还是中国”。据悉，作者已经更新了他们的样本至1000例，但目前尚未通过同行评议发表出来。

5、关于病毒的起源，我国的学者也发布过不少论文，剑桥大学这篇研究几乎是在重复我国学者的工作，正如欧美的防疫一步步验证我国已经验证的问题（比如戴口罩、加强隔离等）。

来源：腾讯医典她知（ID：TXydtazhi）

作者：蒋永源（知乎大V@阿源老师第三军医大学内科学硕士）

编辑：叶正兴、王凤灵、乔辉

排版：周舟

运营：赵亚楠

统筹：张宁

一场新冠病毒疫情，始于2019年年底，结束似乎还遥遥无期，还有愈演愈烈之势。

但是，这次疫情源头是哪儿，一直备受关注。

近日，一项来自剑桥大学遗传学家彼得·福斯特（Peter Forster）博士团队的研究引发热议，他们从新冠患者分离的第一批160个完整基因组序列分析发现，新冠病毒起源可能来自美国和澳大利亚，而不是中国武汉患者。

（剑桥大学新冠病毒进化研究引发争议。来源：剑桥大学官网）

无独有偶。4月10日，国家卫健委高级别专家组成员、中国疾控中心流行病学首席科学家曾光教授接受媒体采访，谈及海外疫情时也表示：“如果（疫情）没有控制住，只能说明两个问题：一是可能除了武汉以外，还有别的源地，我们没有发现，也许在国外还有；另一个问题，也许是因为他们防疫措施不到位。”

（曾光教授判断，病毒源头不排除来自国外的可能性。来源：中新视频）

新冠病毒的来源，已经成了一个“烫手的山芋”，它到底来自哪里，我们一起来看看。

新冠病毒源自哪里？

3月30日，剑桥大学研究人员在《美国科学院院刊》(PANS)以“Contributed”（注：Contributed的一种机制，即可通过院士内推发表论文。）的形式发表了一篇针对病毒溯源的研究，他们发现全球的新冠病毒已经变异为A、B、C三种类型，并且这三种类型的病毒在全球分布范围各不相同[1]。

（英国剑桥大学研究人员关于新冠病毒进化的研究快速发表。来源：PNAS官网）

仔细看来，这篇论文沿用了中国武汉病毒研究所石正丽团队发现的BatCovRaTG13病毒[2]（即新冠病毒在动物中的”祖先”）作为源头，从“全球共享流感数据倡议组织”（GISAID）中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了系统进化网络。

（通过全球不同地区来源新冠病毒基因组做出的进化树。来源：剑桥团队研究[1]）

A群新冠病毒，是在人类社会里传播的最原始的病毒，上图可以看出：A群在中国、东亚、美国、澳大利亚、欧洲均有分布。

这项进化分析研究的作者将A群分为了两个亚群：

T-等位基因亚群中，有4个中国人（来自中国广东省）带有祖先基因组，而3名日本人和两名美国病人则有许多突变，据报道，这些美国患者有曾在武汉疑似疫情暴发地的居住史；

C-等位基因亚群，其中包括来自武汉的5个人（有两个携带祖先基因），另外8个来自中国其他地区和邻近国家的东亚人，该亚群有近一半（15/33）主要位于美国和澳大利亚。

(剑桥新冠病毒进化研究对病毒起源的分析。来源：剑桥团队研究[1])

B群新冠病毒，被认为是通过A群突变而来，分布以亚洲为主（93个里面占74个），中国武汉22例，东部其他地区31例。较早的B群完全在东亚传播（共26个），但是亚洲以外的每个B群都进化出了突变（共19个），作者认为这种现象可能不是因为B群在中国传播而自然发生的突变导致的，而是因为B群本身适应了亚洲人群，需要再次突变以适应欧美人群。

而C群冠状病毒被认为是B群突变而来，在中国大陆不存在，主要在欧洲分布（11例），新加坡有5例，中国香港、中国台湾和韩国也有。

该论文作者还讨论了病毒在欧美的传播链条：

巴西的第一例病人是访问意大利后感染的，其病毒属于C群；

墨西哥的病毒也是意大利起源的，是2020年2月28日在墨西哥的意大利旅行者身上被检测出来；

意大利的病毒源头是德国，一位在慕尼黑Webasto公司工作的员工。

结合上述信息，这篇论文本身并没有回复大家都关心的问题“新冠病毒是起源于美国，还是中国”。

据悉，作者已经更新了他们的样本至1000例，但目前尚未通过同行评议发表出来。

而后，论文作者Peter Forster博士接受了环球时报耿直哥采访表示[3]，不论是哪篇论文，目前仍无法就病毒的来源地给出一个明确的答案。

他对A族群的分布问题，也做出了回应：

“为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现，这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统，所以才变异成了B型。但也可能是因为，武汉当地更多的病例是由B型感染者传染出去的，即遗传学上的“奠基者效应”（founder effect）。”

至于A型为何更多出现在美国和澳大利亚，他认为这有可能是因为A型更适应那里人的免疫系统。

但是，A型在武汉出现过，感染过一些武汉人，也感染过有武汉居住旅行史的美国人。

所以，从现有证据来看，美国的A型病毒仍然可能是从武汉居住史这个途径过去的。而并不是有些人猜测的“起源于美国”。

（Peter Forster博士回应耿直哥采访原文。来源：环球时报评论[3]）

“病毒源自美国”真的实锤了吗？

事实上，关于病毒的起源，我国的学者也发布过不少论文，剑桥大学这篇研究几乎是在重复我国学者的工作。正如欧美的防疫，一步步验证了我国已经验证过的问题（比如戴口罩、加强隔离等）。

2月21日，国内的预印本网站ChinaXiv上曾发表过一篇论文，也是将新冠病毒分为了三个族群。

（国内学者2月份发表的新冠病毒进化传播研究。来源：ChinaXiv[4]）

当时，这篇论文主要的热点集中在破除了“病毒源自华南海鲜市场”的认知，但我们仔细阅读下来就会发现，剑桥大学的研究几乎和该论文如出一辙。

（国内学者2月份新冠病毒进化传播研究里的全球分布地图。来源：ChinaXiv[4]）

可以看到，同样的有A、B、C三个族群，不过我国学者是以B群为最早期的病毒群；

而后来我国学者这篇论文，被台湾某节目引用论述是否源自美国而大火，腾讯医典此前也曾专门做过解读：

美国虽然有更多的病毒种类，但是基本上都与中国患者有关：患者要么到过中国，要么在中国以外的国家接触过中国的患者。

（美国确诊病例分布和溯源。来源：美国CDC[5]）

因此，分析了这么多，源头到底是哪儿？目前暂未可知。

不过，从越来越多的研究追溯发现，中间宿主可能是分布在东南亚国家的马来西亚穿山甲，病毒的起源可能不是中国。

寻找真正的源头是科学问题，也是让类似的疫情不会再次上演的重要因素，我们就让子弹再继续飞一会吧。

参考文献

[1] Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, et al. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. PANS. 2020.

[2] Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579(7798):270-273.

[3] 环球时报新媒体. 《这篇论文，能说明“病毒并非来自中国，而是美国吗”？》

https://view.inews.qq.com/a/20200411A0627T00

[4] Yu WB, Tang GD, Zhang L, et al. Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data. ChinaXiv. 2020:202002.00033.

[5] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-in-us.html